Подскажите как закрыть паспорт сделки, без штрафов

[stiogmazi]

Но ошибочно товар был ввезен по другим договорам частями без паспорта сделки.

Чего-то Вы лукавите... Что значит "ошибочно по другим договорам"? "Ошибочно", но, я надеюсь, Вы в здравом уме составили и подписали вместе с китайцами другие договора? И так же "ошибочно" копии этих договоров отдали таможне при таможенном оформлении ввозимого товара? Не надо наводить тень на плетень... "Ошибочно", тоже мне...

Как мне закрыть паспорт сделки без штрафных санкций, не нарушая закон.

Сам по себе факт "незакрытия ПС" не нарушает никакого закона. Пусть ПС так и будет открытым. Другое дело, если Вы уже платили китайцам за ввезенный товар в рамках этого ПС. Но Вы про это ничего не пишете...